四只生活在纽约下水道里的小乌龟因为有毒的放射性物质的污染，开始向他们接触最多的物种--人类“进化”，并在鼠师傅斯普林特的谆谆教导下，变成了四个最可爱、最善良、最勇敢的绿壳英雄！第一次走出秘密栖身的下水道，这些忍者兄弟就将面对一个奇妙又危机四伏的世界——大都市纽约。敌人比以往更强大，忍者龟们对比萨饼的热爱有增无减，他们的忍术日臻完美，搞笑功力也更有长进！
张生白以追逐利益为先，而李成乾则追求诚信，张生白用诡计迫使李成乾离职。李成乾回乡途中遭遇车祸，被凤凰村村民赵富贵舍命相救。为了报恩，李成乾留在凤凰村教书育人，并抚养救命恩人之子赵出息。其间李成乾与徒弟简影秘密创办公司，将一生经验传给赵出息，并留下重要遗嘱。赵出息为改善家乡环境出来打工，在李成乾女儿李青衣的安排下与简影重逢，加入三江集团。在企业危机中，他稳住现金流，揭露幕后黑手，根据遗嘱成为董事长。凤凰村遭泥石流，赵出息挺身而出，却和张生白再次产生矛盾。李青衣公开事件真相，张生白悔不当初并承认了错误。凤凰村的重建工作如火如荼地展开。
